Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hmgn5Q9JL35 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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