Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ldb3Q9JKS4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms