Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim39Q9ESN2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim39Q9ESN2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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