Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rtn3Q9ES97 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rtn3Q9ES97 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rtn3Q9ES97 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rtn3Q9ES97 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtn3Q9ES97 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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