Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp29Q9ES63 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp29Q9ES63 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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