Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tspan4Q9DCK3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tspan4Q9DCK3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tspan4Q9DCK3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tspan4Q9DCK3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan4Q9DCK3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tspan4Q9DCK3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tspan4Q9DCK3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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