Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Z6

Atg101, Autophagy-related protein 101, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg101Q9D8Z6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg101Q9D8Z6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms