Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PudpQ9D5U5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms