Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4930564D02RikQ9D4S4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms