Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urm1Q9D2P4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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