Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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