Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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