Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhobtb3Q9CTN4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms