Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms