Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssxb1Q9CPU1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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