Protein–RNA interactions for Protein: Q99N80

Sytl1, Synaptotagmin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sytl1Q99N80 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sytl1Q99N80 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms