Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a6cQ99N08 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms