Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp16Q99LG0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp16Q99LG0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms