Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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