Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacsin3Q99JB8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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