Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms