Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim59Q922Y2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms