Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atl3Q91YH5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms