Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgms1Q8VCQ6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sgms1Q8VCQ6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sgms1Q8VCQ6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sgms1Q8VCQ6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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