Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnajc28Q8VCE1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc28Q8VCE1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms