Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim29Q8R2Q0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim29Q8R2Q0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms