Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Mtmr3Q8K296 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtmr3Q8K296 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms