Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim32Q8CH72 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim32Q8CH72 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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