Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E4f1Q8CCE9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms