Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpcpd1Q8C0L9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpcpd1Q8C0L9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms