Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gga3Q8BMI3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gga3Q8BMI3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms