Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbfox3Q8BIF2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rbfox3Q8BIF2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms