Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim6Q8BGE7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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