Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms