Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ddx55Q6ZPL9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ddx55Q6ZPL9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ddx55Q6ZPL9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ddx55Q6ZPL9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ddx55Q6ZPL9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ddx55Q6ZPL9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ddx55Q6ZPL9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx55Q6ZPL9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms