Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp8b3Q6UQ17 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms