Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pram1Q6BCL1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms