Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna3Q65CL1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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