Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top2bQ64511 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms