Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp1Q62209 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms