Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Scn9aQ62205 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn9aQ62205 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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