Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga6Q61739 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms