Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad21Q61550 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad21Q61550 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms