Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tbc1d1Q60949 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tbc1d1Q60949 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms