Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprnQ60673 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprnQ60673 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprnQ60673 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprnQ60673 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprnQ60673 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PtprnQ60673 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprnQ60673 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PtprnQ60673 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms