Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm1Q60636 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms