Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrrc43Q3V0L5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrc43Q3V0L5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms