Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ttc9Q3V038 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9Q3V038 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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