Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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