Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf180Q3U827 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf180Q3U827 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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